Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Stx2Q00262 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms