Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbp10Q000W5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbp10Q000W5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms