Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nkx3-1P97436 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx3-1P97436 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx3-1P97436 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nkx3-1P97436 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx3-1P97436 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nkx3-1P97436 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx3-1P97436 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nkx3-1P97436 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nkx3-1P97436 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nkx3-1P97436 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nkx3-1P97436 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nkx3-1P97436 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx3-1P97436 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx3-1P97436 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nkx3-1P97436 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nkx3-1P97436 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nkx3-1P97436 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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