Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms