Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufm1P61961 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms