Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd6P61407 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd6P61407 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms