Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Csrnp1P59054 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Csrnp1P59054 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Csrnp1P59054 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms