Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpdl3bP58242 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms