Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms