Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
StomP54116 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
StomP54116 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
StomP54116 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
StomP54116 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
StomP54116 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
StomP54116 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
StomP54116 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms