Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx2P43241 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms