Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx2-5P42582 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx2-5P42582 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms