Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms