Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Mmp3P28862 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms