Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pax3P24610 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pax3P24610 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms