Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TP20293 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TP20293 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TP20293 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TP20293 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TP20293 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TP20293 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TP20293 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TP20293 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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