Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hoxb1P17919 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hoxb1P17919 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hoxb1P17919 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hoxb1P17919 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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