Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs1P17533 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs1P17533 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms