Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf1P15314 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf1P15314 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Irf1P15314 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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