Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms