Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb2P0C1T1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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