Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf1P09925 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf1P09925 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf1P09925 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf1P09925 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf1P09925 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf1P09925 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf1P09925 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf1P09925 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf1P09925 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Surf1P09925 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Surf1P09925 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf1P09925 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf1P09925 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms