Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa9P09631 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms