Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XlrP05531 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XlrP05531 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XlrP05531 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XlrP05531 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XlrP05531 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XlrP05531 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XlrP05531 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XlrP05531 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XlrP05531 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XlrP05531 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XlrP05531 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XlrP05531 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XlrP05531 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XlrP05531 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XlrP05531 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XlrP05531 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms