Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P04212 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
P04212 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
P04212 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04212 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04212 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04212 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P04212 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms