Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hoxa7P02830 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa7P02830 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms