Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01657 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01657 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01657 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01657 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01657 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01657 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01657 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01657 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01657 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms