Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igk-V19-17P01633 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igk-V19-17P01633 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms