Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl20O89093 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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