Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hcn2O88703 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms