Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emp3O35912 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms