Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2bO35690 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phox2bO35690 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phox2bO35690 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2bO35690 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2bO35690 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2bO35690 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2bO35690 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms