Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra3O35118 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra3O35118 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms