Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kif3cO35066 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kif3cO35066 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms