Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EllO08856 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EllO08856 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EllO08856 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EllO08856 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EllO08856 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EllO08856 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EllO08856 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EllO08856 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EllO08856 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EllO08856 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EllO08856 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EllO08856 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EllO08856 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EllO08856 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms