Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eftud2O08810 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms