Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21818J3KMS6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21818J3KMS6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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