Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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