Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp558E9Q1J0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp558E9Q1J0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp558E9Q1J0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp558E9Q1J0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp558E9Q1J0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp558E9Q1J0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp558E9Q1J0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp558E9Q1J0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp558E9Q1J0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp558E9Q1J0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp558E9Q1J0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp558E9Q1J0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Zfp558E9Q1J0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Zfp558E9Q1J0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Zfp558E9Q1J0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp558E9Q1J0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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