Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms