Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms