Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cul4bA2A432 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cul4bA2A432 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms