Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms