Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv1A0A0B4J1G7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trbv1A0A0B4J1G7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Trbv1A0A0B4J1G7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv1A0A0B4J1G7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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