Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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