Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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PDCD1Q15116 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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