Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TCIRG1Q13488 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms