Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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