Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms