Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC00160-201ENST00000430635 693 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC02162-201ENST00000512521 574 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 FCGR3B-204ENST00000531221 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL157895.1-201ENST00000451713 1404 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 FAM41AY1-201ENST00000421205 906 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 Z99758.1-201ENST00000432081 368 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL049820.1-201ENST00000442936 423 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC02148-201ENST00000503877 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms